肺结核
治疗肺结核的支气管内病变：经纤支镜冲洗吸出阻塞支气管的异物、血块、粘稠痰液和分泌物，治疗支气管结核的溃疡性和肉芽性病变;扩张支气管;治疗支气管瘢痕性狭窄;减轻或消除各种原因的肺不张等。
局部化疗给药：经纤支镜局部注入抗结核的化疗药物。全身化疗加局部治疗对支气管内膜结核的治疗效果好。经纤维支气管镜局部注射抗结核药可以使痰涂片阴转率由70.8%提高到96.1%，空洞闭合率由26.9%提高到59.2%，最高可达72%。
对于病情危重、心肺功能明显受损者、1-2周内有大咯血、重症高血压及严重心律失常者，不适宜于支气管镜检查。
支气管肺泡灌洗术是近几年来在纤维支气管镜检查的基础上发展起来的新技术。肺泡灌洗液的涂片和培养均有一定的阳性率，尤以培养的阳性率更高，对于临床上痰少甚至无痰而又不能确诊的少数肺结核病人，肺泡灌洗液的结核菌检测对肺结核的最后确诊更是一种难得的行之有效的方法。