病情持续不见好转，超过2个月以上的就叫做慢性菌痢，一般和急性期治疗不及时或者不彻底、引起痢疾的细菌有了耐药性(抗生素治疗效果不好)或患者机体抵抗力下降有关，也可因为饮食不合适、受凉、过度劳累或精神因素等原因导致转为慢性。
慢性菌痢又包括几种：
(1)迁延型 患者有菌痢病史，症状时好时发，时轻时重。
(2)隐匿型 患者有菌痢病史，但症状已经全部消失，大便培养阴性。
(3)急性发作型 患者的症状类似急性典型菌痢，但程度较轻。
